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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

多国驻蓉驻渝总领事成都共话交流合作愿景******

　　中新社成都2月2日电 (记者 岳依桐)“饮食文化是日中两国民众文化交流的重要部分。成都市民对多元饮食文化非常包容，消费力也不断提高。很多日本相关领域的企业都非常关注成都市场。”2日晚，日本国驻重庆总领事馆总领事高田真里在成都接受中新社记者采访时如是说。

　　当晚，由成都市人民政府主办的2023年领事官员新春联谊会上，来自19个国家的驻蓉驻渝领事官员齐聚一堂，共话交流合作愿景。多位总领事看好成都乃至中国西南地区发展前景，冀深化往来。

　　新加坡驻成都总领事馆总领事陈子勤对新加坡与四川在创新领域的合作信心十足。他认为，尤其是在两地年轻人充满创新精神的当下，政府应该加强支持力度，通过搭建交流平台等方式，鼓励他们寻找机遇、发挥潜力。

　　“2023年应该是非常忙碌的一年。”匈牙利驻重庆总领事馆总领事葛凯达笑道，随着线下商务活动、文化交流活动频率提高，领馆将不遗余力地推动匈牙利和四川在多领域深化合作。“汽车、医疗设备、绿色能源等产业是匈牙利的优势产业，期待与四川在这些行业合作共赢。”

　　“目前在四川投资的荷兰企业数量约40家，相信在接下来的几年里，这一数字能够实现增长。”荷兰驻重庆总领事馆总领事包适告诉记者，对于荷兰企业而言，2023年是挖掘在华投资机遇的一年，随着人员往来的恢复，企业之间的交流也更加方便。“相信企业家们来到四川，了解这里的市场活力后，投资也将随之而来。”

　　包适表示，在文化交流领域，荷兰和中国的艺术家也能为双方民众带去更多艺术享受，从而深化交流。“我们对旅游业的发展也十分乐观，热烈欢迎中国民众到荷兰旅游，感受荷兰文化。”

　　当晚的活动还发布了《“家在成都”生活指南》。该书包括“初来乍到怎么办、玩转蓉城大攻略、工作创业要找谁、家在成都要知晓”等主题，旨在助力中外“蓉漂”更好在成都工作生活。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）